世卫组织发布的世界医疗体系排行榜中，马耳他医疗体系位居全球第五，远超英国(18)、澳大利亚(32)、瑞典(32)、加拿大(30)、美国(37)。
马耳他的人均寿命为81.5岁，超过欧洲的平均水平，这也是近年来马耳他成为全球养老、移民热门目的地的原因之一。马耳他是养老的天堂，医疗系统的发达为其提供了助力。
马耳他具有悠久的医疗服务历史，高水平的医疗人才，完善的医疗硬件设备，以及优质的康复环境。同时，也重视患者的治疗体验。整个马耳他分为8个片区，每个片区都设有24小时运行的医疗中心(Health Centre)，居民只要凭证件就可以就诊。
公立医疗系统
公立医疗依靠国家税收和社会保障系统的支撑，覆盖了住院、处方、妊娠生育、外科手术和康复等各个医疗环节，旨在为所有在马耳他居住的人群提供一系列全面的医疗服务。马耳他的公立医院一共有7所，其中一个在Gozo岛上。
马耳他拥有强大的全科家庭医生队伍为其国民提供初级医疗保健服务，其职责范围包括开处方药、转诊、治疗急性及慢性病、疾病预防和健康教育。医护人员分为全科医生，专家、牙医、急救护理人员和护士，为病人提供包括免疫、儿科、谈话治疗、牙医、母婴护理、糖尿病治疗等各类医疗服务。
绝大多数的全科医生在全年都提供昼夜服务，病人不需要提前预约，只需前往就诊，并由值班医生负责。公立医院则主要对由家庭医生转介的病人二级和三级医疗护理服务。全科医生根据病情决定自己治疗还是转到公立医院治疗。
在马耳他，所有的诊费、急诊用药均为免费，一般用药就需要凭处方自己去药房购买。公费医疗的优势特别能够通过住院体现，患者住在医院而完全不需要自己掏钱。同时医院会提供专门的看护服务，病人家属只要到点去探视就行。由于医生的收入与看病多少也不直接挂钩，加之有免费医疗提供保障，所以类似药费提成的问题，或是医患之间的纠纷，在马耳他便不存在。
私立医疗系统
私立医疗作为公立医疗的补充，近年来在马耳他发展很快，私立医疗支出占医疗总支出的三分之一，支出速度超过公立医疗。
私立医疗的经济来源主要来源于自费以及自愿的医疗保险。大多数人选择付费的医疗主要是因为服务更加方便，护理的延续性更好。
在私立医疗体系中，病人可根据自己的病情联系各科室专家，也可以通过全科医生的帮助联系专科大夫，非处方药可以直接在药房买到，但是处方药还是需要全科医生、专家以及牙医开处方才可。
在马耳他医生多点执业是合法的，因而相当一部分的私人诊所的医生很多也同时就职于公立医院。所以服务也是有保证的。
私立医院中非常有名的是圣詹姆斯医院，成立于1984年，是马耳他顶级的国际化私立连锁医疗机构。白内障手术和屈光、激光手术在业内广受好评，该医院不仅有优秀的全科医生及各科目的专家，还有更加现代化的医疗设备。
除了上述的公立医院和私立医院之外，马耳他还有地方诊所、私人诊所等方式，进一步完善了当地的医疗体系。
马耳他就医流程
普通感冒、头疼、口腔溃疡等小毛病，可直接在家附近的药店购买非处方药，或咨询店内的全科医生，按照全科医生的诊断拿药。
需要看医生则可预约家附近的公立诊所/健康中心或私立诊所接受治疗，有全科医生针对病情做相应的检查和诊疗。
如果门诊的全科医生觉得病人病情比较严重，则会把患者推荐到公立或私立医院接受进一步的住院治疗。
住院治疗后如需进一步康复治疗，医生会把病人推荐到专门的康复医院做进一步的康复训练，直到病人可以康复出院。
